Группа подростков — Кана, Юи, Такуми и другие — живут в странном мире, где взрослые вдруг теряют сознание. Очнувшись, они становятся пустыми, почти куклами. Никто не знает почему. Дети остаются одни. Они пытаются выжить, но что-то не так: город затягивает их в повторяющиеся дни, будто ловушку. Каждый раз — одно и то же утро, те же события. Юи злится, Такуми отстраняется, а Кана ищет ответы. Потом появляется мальчик с чёрными глазами — Хикари. Он знает больше, чем говорит. Мир вокруг начинает
Главный герой, Сусуки Нодзоми, живёт в машине, без денег, без будущего. Однажды он встречает странного человека — Манабу Ито. Тот утверждает, что может видеть гомункулов — искажённые сущности, рождённые подавленными травмами людей. Ито предлагает Нодзоми опасный эксперимент: просверлить в черепе крошечное отверстие, чтобы открыть «третий глаз». После операции мир меняется. Нодзоми начинает видеть гомункулов — уродливых, жалких, иногда пугающих. Они отражают боль своих хозяев. Среди них —