Томас Андерсон работает программистом в крупной компании и продолжает вносить новшества в игру, ставшую популярной среди геймеров. Гениальный программист погружается в собственные мысли, где воображение играет с ним злую шутку. Вследствие участившихся приступов, он вынужден посещать психотерапевта и принимать препараты, которые на время успокаивают и помогают сохранить ясность ума.

Но даже на сеансе у доктора, Томаса посещают непонятные видения. На один момент возникает сгенерированная компьютерная реальность, а затем он перемещается в настоящий мир. Живая легенда и величайший геймдизайнер современности знакомится в кафе с симпатичной официанткой Тиффани и не может избавиться от странного ощущения, что уже встречался с ней в другой жизни. Все становится намного хуже, когда Нео сталкивается с двумя незнакомцами, которые предлагаю погрузиться в Матрицу.